Non posso che essere d'accordo con te!
Sono 10 anni che uso Feflow e devo dire che offre potenzialità notevoli, accanto ad un uso che può andare dal molto semplice al molto complesso a seconda dell'utilizzo che se ne fa.
E' però vero che conosco pochissimo MODFLOW, quindi non ho un gran confronto (ho usato GMS che è una via di mezzo tra i due, più o meno.