Ciao,
se ho capito bene, provo a risponderti.
Con il filtro di cross-correlazione il programma non fa altro che
shiftare dati acquisiti con stessi tempi in dati acquisiti alla stessa profondità (dipende dalla diversa posizione di registrazione dei sensori). Fatto ciò il programma dovrebbe restituirti un grafico per lo più simmetrico all'asse verticale con un max sull'asse stesso. Trovi le spiegazioni anche sul manuale.

Un saluto

Fa' sempre la cosa giusta.