Ciao, allora esiste un plugin che si chiama raster trasparency, tramite il quale puoi eliminare totalmente il colore che vuoi.
in alternativa puoi usare il metodo classico, vai nelle proprietà del raster e da trasparenza metti il valore 255 che corrisponde al bianco.
Per la seconda domanda, non ricordo se c'è un plugin o qualche "funzione specchio" negli strumenti di geoprocessing....controlla bene nei plugin... ciao