Ciao Alex85,
un po' come è stato scritto negli interventi precedenti, per elaborare in 3D, devi ovviamente prima acquisire un set di dati che ti permetta di ricostruire correttamente un volume tridimensionale.

Il volume in 3D lo si ottiene montando diversi profili bidimensionali.

Sull'acquisizione il discorso è un po' lungo, ma bisogna ripetere diversi rilievi paralleli, con una inter-distanza che consenta di non effettuare errori in fase di ricostruzione (questo dipende dalle dimensioni e profondità di quello che si cerca).

Esistono vari software che permettono di elaborare e visualizzare un dato 3D, le stesse case costruttrici dei georadar sviluppano i loro ottimizzati per i software di acquisizione che usano gli stessi sistemi.
I costi sono variabili sia a seconda dei software che dei moduli di elaborazione richiesti.
Esistono programmi che costano anche meno di 4000 euro.

Infine sulla metodologia ti conviene fare un corso di formazione.
Il processing radar nel suo complesso è un discorso un po' difficile da fare via forum.
Se hai bisogno chiedimi pure.