Non so dirti circa la discrepanza tra i due dati.
Anche io ho utilizzato un software di conversione.
La migliore soluzione sarebbe quella di avere la tavoletta igm del sito e calcolarselo manualmente alla vecchia maniera.
Comunque quando si ha a che fare con coordinate è sempre necessario specificare il sistema di riferimento ed il datum.
Dire Utm e non specificare il datum ED50/wgs84 ecc, porta ad errori nella localizzazione di diverse centinaia di metri.
Buona giornata.