NTC 2008:
3.2.2 CATEGORIE DI SOTTOSUOLO E CONDIZIONI TOPOGRAFICHE
Categorie di sottosuolo
Ai fini della definizione dell’azione sismica di progetto, si rende necessario valutare l’effetto della risposta sismica locale mediante specifiche analisi, come indicato nel § 7.11.3. In assenza di tali
analisi, per la definizione dell’azione sismica si può fare riferimento a un approccio semplificato, che si basa sull’individuazione di categorie di sottosuolo di riferimento (Tab. 3.2.II e 3.2.III).

Quindi la RSL è la norma, la valutazione semplificata è l'eccezione.
le categorie semplificate sono applicabili SOLO con "graduale miglioramento delle proprietà meccaniche con la profondità" (da descrizione delle categorie).
Se questa condizione non viene rispettata, e quindi, ovviamente, quando hai un'inversione importante, la categoria sismica del sottosuolo è S2, per cui le NTC indicano:
"Per sottosuoli appartenenti alle ulteriori categorie S1 ed S2 di seguito indicate (Tab. 3.2.III), è necessario predisporre specifiche analisi per la definizione delle azioni sismiche".