Io ho trovato il software WHAEM, mi pare distribuito dall'EPA (prova a fare una ricerca).
E' valido perchè è un modello analitico di flusso bidimensionale.
I limiti, come probabilmente saprai, sono legati all'impossibilità di assegnare variazioni spaziali (sia orizzontali, che verticali)della trasmissività e della porosità efficace.
Dal punto di vista modellistico il tutto può essere superato con l'utilizzo di modelli di flusso tridimensionali alle differenze finite (MODFLOW ad esempio), ma il principale problema è legato alla scarsità di dati disponibili (almeno questo è ciò che capita a me molto sovente). Per cui alla fine può essere paradossalmente inutile disporre di un motore di calcolo in grado di raggiungere elevati livelli di discretizzazione del dominio, quando poi non si sa bene quali parametri assegnare e dove.
D'altro canto l'utilizzo di software analitici come WHAEM fa sì che vengano disegnate delle aree di rispetto geometricamente regolari, il che è del tutto irreale, ma consente di fornire un ordine di grandezza al problema.
Una via di mezzo tra i due software citati, potrebbe essere ASMWIN 6.0 (anche questo gratuito, ma forse con qualche limitazione) che in pratica è come MODFLOW (permette di organizzare il dominio secondo una griglia), ma è solo bidimensionale (Non consente la discretizzazione verticale degli strati). Il problema è che quando l'ho usato (durante la tesi) mi pare che desse dei risultati sbagliati o non precisi, per cui fai attenzione.