sulle aree di salvaguardia delle opere di presa, oltre alla normativa, dovresti trovare materiale sui testi di idrogeologia, e anche on-line, cosi come sulla modellistica in generale e sui software più noti (es. modflow).

questo è un buon articolo: http://www.proaqua.it/papers/0036.pdf

per il software vedi se ti basta la demo di gms (ha sia modflow che femwater), altrimenti devi acquistare il programma che ritieni più appropriato al caso.

fai molta attenzione ai risultati che ottieni; visto il problema, se ci sono inquinanti 'in giro' fai rivedere il lavoro da qualcuno più esperto.