normalmente no, quando sei su ArcMap, clic su File > Map Properties > Data Source Options.. > Store relative path names
Questo dovrebbe bastare per far cercare al tuo .pmf i files presenti nelle cartelle che si trovano all'interno della cartella dove hai messo il tuo file .pmf, senza badare al C:/ bla-bla. Evidentemente devi avec ben organizzato i tuoi files e non averli sparpagliati in ogni dove nel tuo HD.
Almeno questo funge sugli mxd classici ma non credo che sia diverso per ArcReader.

Enrico



Enrico Bonino
Museum Curator at the Back to the Past Museum, Cancun, Mexico
www.backtothepast.com.mx
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www.enrico-bonino.eu