Ciao
il mio consiglio va assolutamente su Visual Modflow. Sia GWV che GMS li trovo meno intuitivi e snelli nell'utilizzo (soprattutto GMS). Nella versione base di VModflow (circa 1200 $) puoi ottenere visualizzazioni carine in 2D. Per il 3D devi prendere una versione più costosa (vedi www.waterloohydrogeologic.com); secondo me non è comunque un requisito così fondamentale un output graficamente bello per ottenere elaborati tecnici validi (io quasi sempro esporto i risultati in formato dxf).
Non ho capito a cosa ti serva l'interfacciabilità con arcview (il che non significa che in alcuni casi non sia utile...), ma con VModflow non ce l'hai. Che io sappia, hai qualcosa del genere solo con GMS, che costa però moooolto di più.
Per quanto riguarda Processing Modflow, puoi ottenere gratis la versione 5.3 (quella presente nel libro)scaricandola dal sito. E' perfettamente funzionante, è sicuramente meno confortevole nell'uso di VModflow e, come licenza, non potresti utilizzarlo x scopi commerciali.
Buona fortuna


Stefano Zanarello