Forse hai le idee confuse.......
QGIS è un Desktop GIS mentre Pmapper non è altro che un framework che ti permette di visualizzare le tue mappe prodotte con qgis o altro sul web.....
Comunque dai un occhiata qui:
www.gfoss.it
Per quanto riguarda l'errore prova a settare il config.ini....ci deve essere una stringa nella quale modificare la versione di mapscript..se è php_mapscript_48.dll devi scrivere 48......
Fammi sapere

email: echo "dfp^k^ivpq=sfodfifl+fq" | perl -pe 's/(.)/chr(ord($1)+3)/ge'
--------
Il problema dell'umanità è che gli stupidi sono strasicuri, mentre gli intelligenti sono pieni di dubbi. (B. Russell)