Scusa il ritardo nella risposta... avevo perso di vista il post!
Ti consigliano di installare postgis a parte perchè è probabile che la versione già inclusa in postgres non sia l'ultima.
Da come descrivi la situazione credo che tu stia lavorando in ambiente windows.
Reinstalla postgresql (per disinstallarlo completamente devi anche eliminare l'utente postgres dagli utenti di windows tramite gli strumenti di amministrazione) e non flaggare postgis tra le funzioni aggiuntive.
Finita l'installazione di postgresql lancia l'eseguibile di postgis (scaricato dal sito del progetto): NON selezionare l'opzione "create database" e lascia tutto il resto di default.
Lancia pgadmin3 e connettiti al server locale di postgresql. Crea un nuovo db ed usa template1 come template. Nello schema public del db appena creato dovrebbero esserci 2 tabelle (geometry_columns e spatial_ref_sys)
Per controllare la versione di postgis apri la finestra sql di pgadmin e digita:
select postgis_full_version()
Dovrebbe essere tutto...
PS
se hai bisogno di info più precise sull'installazione di postgresql (sia sotto win che, magari, sotto linux) fammi sapere.
PPS
se vuoi una guida alle funzioni di postgis c'è il manuale sul sito ufficiale... e poi c'è sempre la comunità gfoss (
www.gfoss.it)