Col cad parò non hai alcune delle caratteristiche peculiari del gis, che ripeto, non è uno strumento per "disegnare".
Il dbms su cui il gis poggia, per esempio, garantisce l'integrità dei dati.
Se ti servi di un formato topologico per la fase di editazione, questo, definendo delle relazioni spaziali tra gli elementi, ti permette di effettuare delle query spaziali.
Se usi un gis open, come gvSIG, qgis, jump o grass, ti consiglio di sfruttare le possibilità che ti offre postgres (con postgis).

ciao