Diciamo che ms4w è l'ambiente di lavoro...
il file di configurazione di mapserver (il cosiddetto mapfile) è la cosa di cui ti devi preoccupare per raggiungere il tuo scopo.

Un framework (io uso ka-map... lo preferisco a pmapper) funge da "wrapper" e ti consentirà di visualizzare facilmente la mappa creata dal mapserver in un ambiente amichevole e già interattivo. Te lo consiglio fortemente!

Non utilizzandolo devi costruirti a mano un template per aggiungere l'interattività alla mappa. Oppure sfruttare le potenzialità di server WMS di mapserver, ma qui il discorso si amplia ancora e magari è bene affrontare una cosa alla volta.

Per scaricare ka-map già pronto per ms4w clicca qui

Qui trovi anche altri framework già pronti per lavorare con ms4w

Mettere su il tutto con ms4w è quasi banale. Per ora concentrati nello studiare come costruire un mapfile.

ti do alcuni link:
http://mapserver.gis.umn.edu/search?SearchableText=italian

http://biometry.gis.umn.edu/tutorial/