Grazie per i consigli, ho già utilizzato Xtools, non mi ricordavo che presentava anche il comando Erase (che tra l'altro è tra quelli che non si disattivano dopo i 30 gg fatidici). Però l'Erase che mi presenta questa estensione (se non ho letto male l'help) agisce tra due layer, tipo il clip che elimina tutto ciò che stà fuori una certa area, mente il mio problema è di avere due poligoni sovrapposti sullo stesso layer poligonale e dover far si che il più piccolo interno diventi "incastrato" nel più grande esterno.
Buon fine settimana a tutti

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