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però pensavo... e se inserissi nel gis i miei layer direttamente con coordinate wgs84 sarebbe una buona soluzione? La sovrapposizione, che si ha esportando il layer, è praticamente perfetta.
perchè no? prova...
riproietta il layer in wgs84 lat/lon

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Rimane il fatto che in un GIS sarebbe + corretto avere dei layer il cui sitema di coordinate non sia di tipo geographic ma di tipo projection. Che ne pensate?
non è che è più corretto... dipende da cosa ti serve.
Finchè puoi utilizzare un sistema proiettato, essendo le carte (ed i monitor...) sul piano, avrai una resa migliore, ma se per vari motivi ti trovi a dover rappresentare un layer in un sistema lat/lon, non si tratta di una operazione di per sè scorretta...