TAN sinceramente non capisco i tuoi dubbi!!!
1) puoi avere la cartografia al 25000 e fare un profilo al 10.000 se vuoi, anzi sicuramente ci lavori meglio ed eviti di fare "cacatine di mosca" da 0,5 mm.
2) se la scala grafica, così si chiama il segmento graduato di cui parlavi, ti dice che 4 mm sono 100 m la scala è al 25.000
3) per il profilo e poi per le sezioni se hai una base geologica al 25000 la precisione che otterrai è da 25.000 cioè considerando l'errore grafico di 0,2 mm (tratto grafico) la precisione è di 5 m, quindi è inutile ed assurdo andare a precisioni inferiori
4)la sezione la devi poter guardare e ci devi poter lavorare ..... quindi NON puoi fare una sezione lunga magari 5 cm e con livelli disegnati a 0,5 mm !!! la devi studiare con la lente di ingrandimento !!

5)qui voglio essere polemico! Dimmi la verità la tua tesi era in cristallografia sistematica ? e poi se posso ... in quale ateneo ti sei laureata?