Non è un problema di registrazione (a quanto capisco) ma di dos.
Io uso win xp su ubuntu tramite un emulatore (VirtualBOx) e non mi ha dato problemi (come già ti dicevo).

Del problema che tu hai segnalato (che credo esterno al PMWin in sè, ma più del dos) ne parlano in questo forum

http://www.hwupgrade.it/forum/showthread.php?t=977220

Tanto per fare una prova, ti funzionano altre applicazioni che girano direttamente su dos?