Ciao. Dimmi se ho capito bene: il tuo punto di partenza è un dwg unico (che deriva dall'unione di diversi dwg) su cui è disegnata una base topografica vettoriale, e vorresti trasferire il tutto sul GIS lavorando con gli shape. Hai provato ad aprire il dwg direttamente con arcmap? Riesce a caricare tutto? Per inciso, arcmap "non vede" i blocchi di autocad, quindi il disegno va esposo prima di aprirlo con il gis. Questa operazione implica però un notevole aumento di elementi che, spesso, il gis non riesce a gestire con facilità. Comunque, se dovessi riuscire a visualizzarlo in maniera completa con arcmap, non dovresti far altro che cliccare con il tasto destro sul layer "polyline" e fare DATA\EXPORT DATA che ti esporta il tutto in un nuovo shape. Se il tuo problema fosse l'eccessivo numero di elementi da gestire, sarebbe sufficiente ripetere questa operazione per ogni quadrante, in maniera separata.
Spero di esserti stata utile e tienimi aggiornata.