Ciao,
ritengo che GRASS sia un ottimo software per l'analisi territoriale. Ha molti moduli (credo circa 350) per l'analisi sia di carte raster che vettoriali, anche se il meglio di se lo da proprio con i raster. E' in grado di importare gli shape file perchè utilizza le note librerie gdal. Se hai intenzione di utilizzare l'ultima versione disponibile (la 6.4RC5), ti consiglio di evitare l'interfaccia python, perchè ha ancora parecchi bug. Inoltre per questa versione credo che non esista ancora il porting di NVIZ.

Ciao
Costantino